https://repositorio.ufba.br/handle/ri/37972
Tipo: | Dissertação |
Título: | Associação genômica ampla para identificação de genes candidatos relacionados com metabólicos proteícos em ovinos Santa Inês. |
Autor(es): | Souza, Taiana Cortez de |
Primeiro Orientador: | Pinto, Luís Fernando Batista |
metadata.dc.contributor.referee1: | Pinto, Luís Fernando Batista |
metadata.dc.contributor.referee2: | Camargo, Gregório Miguel Ferreira de |
metadata.dc.contributor.referee3: | Balieiro, Júlio César de Carvalho |
Resumo: | Níveis de albumina e ureia no sangue são usados como indicadores clínicos, bem como para avaliar o estado nutricional de um animal. Assim, o presente estudo tem por objetivo realizar análise de associação genômica ampla para dosagens de albumina e ureia em ovinos Santa Inês, a fim de identificar genes candidatos para essas variáveis. Um total de 320 cordeiros foram genotipados com o OvineSNP50 BeadChip. Após o controle de qualidade, 43.996 SNPs foram utilizados nas análises de associação via método ssGBLUP. Foram discutidas janelas que explicam pelo menos 1% da variância genética das dosagens de albumina e ureia. Oito regiões genômicas explicaram 11,6% da variância genética de albumina, sendo encontrados os genes candidatos ALDH7A1, GAPDHS, STRAP, MGTS1, EI24, HAMP, PTPRO, FFAR1, FFAR2, FFAR3, KIRREL2, ITGA8, NPHS1, TYROBP, MAG, DIABLO, PRODH2 e HPD. Sete regiões genômicas foram responsáveis por explicar 12,4% da variância genética de dosagem de ureia, sendo identificados os genes candidatos PCDH9, AZGP1, LAMTOR4, SMURF1, RAB31, ARPC1A, ARPC1B, CNTN1, PDZRN4, NDUFV2, CLOCK e NMU. A maioria destes genes candidatos estão envolvidos em processos biológicos relacionados com funções hepáticas e renais e podem conter variantes uteis ao processo de seleção de ovinos Santa Inês. |
Abstract: | Albumin and urea serum levels are used as clinical indicators, as well as to evaluate the nutritional status of an animal. Thus, the present study aims to performer a genome wide association study (GWAS) to identify candidate genes for albumin and urea levels in Santa Ines sheep. The GWAS analysis was performed with 320 lambs and 43,996 SNPs, using the ssGBLUP method. Regions that explain at least 1% of the genetic variance of the albumin and urea levels were discussed. Eight genomic regions explained 11.6% of the genetic variance in albumin level and the candidate genes ALDH7A1, GAPDHS, STRAP, MGTS1, EI24, HAMP, PTPRO, FFAR1, FFAR2, FFAR3, KIRREL2, ITGA8, NPHS1, TYROBP, MAG, DIABLO, PRODH2 and HPD were found. Seven genomic regions explained 12.4% of the genetic variance in urea level, and the candidate genes PCDH9, AZGP1, LAMTOR4, SMURF1, RAB31, ARPC1A, ARPC1B, CNTN1, PDZRN4, NDUFV2, CLOCK and NMU were identified. The genes found in the current study are involved in biological processes related to hepatic and renal functions and variants in these genes can be useful for breeding schemes in Santa Ines sheep. |
Palavras-chave: | Albumina Cordeiros Metabolismo Proteína Melhoramento genético |
CNPq: | CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::ZOOTECNIA::GENETICA E MELHORAMENTO DOS ANIMAIS DOMESTICOS |
Idioma: | por |
País: | Brasil |
Editora / Evento / Instituição: | UNIVERSIDADE FEDERAL DA BAHIA |
Sigla da Instituição: | UFBA |
metadata.dc.publisher.department: | Escola de Medicina Veterinária e Zootecnia |
metadata.dc.publisher.program: | Programa de Pós-Graduação em Zootecnia (PPGZOO) |
URI: | https://repositorio.ufba.br/handle/ri/37972 |
Data do documento: | 29-Abr-2019 |
Aparece nas coleções: | Dissertação (PPGZOO) |
Arquivo | Descrição | Tamanho | Formato | |
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Taiana Cortez de Souza - 29-04-2019.pdf | 872,94 kB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |
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