Campo DC | Valor | Idioma |
dc.creator | Almeida, Patrícia Hercília Arcanjo de | - |
dc.date.accessioned | 2025-02-14T02:10:39Z | - |
dc.date.available | 2025-02-13 | - |
dc.date.available | 2025-02-14T02:10:39Z | - |
dc.date.issued | 2020-12-17 | - |
dc.identifier.uri | https://repositorio.ufba.br/handle/ri/41220 | - |
dc.description.abstract | The Atlantic Forest is a biome that presents a great diversity of endemic species, as well as
the one that has the highest index of endangered species, a fact that makes the biome a hotspot
for the preservation of biodiversity. The environmental imbalance has a strong power in the
diffusion and the appearance of parasitic diseases in wild mammals, and among the parasites
found there are those caused by protozoa. Thus, the objective of this work was to evaluate the
infection rates among different orders of mammals in Brazil, through systematic review and
meta-analysis and to know the diversity of protozoa in small mammals from the south coast
of Bahia in the State of Bahia. For the review, a search was carried out in the databases
Pubmed, Medline, Lilacs, Science direct and Scielo, without language filter and with 2000-
2020 time filter. To conduct this process, the StArt tool was adopted. Based on the selection
criteria, all studies that reported T. cruzi infection in wild mammals in Brazil were chosen.
For statistical analysis, descriptive statistics, and meta-analysis of the dichotomous event with
binomial distribution were used, conducted in Microsoft Excel. To assess the heterogeneity
between the studies, the calculation of the Q and I
2
statistics was used. After reading all the
abstracts and based on the selection criteria, 35 studies contained important information on
infection in wild mammals. Among the nine orders of wild mammals identified as a reservoir
for T. cruzi, three of these orders had the highest combined frequency: Chiroptera (55.57%);
Carnivorous (38.10%) and Primate (27.85%), due to molecular diagnosis. The detection of
protozoa was performed using tissue samples from wild mammals of the orders Rodentia and
Didelphimorphia, in an organ pool (heart, brain, lung, liver and spleen) of each animal, which
were macerated and stored at -20oC. For the detection of T. cruzi, DNA extraction was
performed using a commercial kit and quantification in NanoDrop®, followed by nested-PCR
for amplification of kDNA sequences using primers S17 and S18. Of the 153 wild mammals
identified in the order Didelphimorphia and Rodentia, specimens of six and thirteen species of
each order, respectively, were examined. A Didelphis aurita showed amplification of DNA
compatible with Trypanosoma ssp, corresponding to 0.65% of the samples examined. For the
analysis of the pools obtained, the new generation sequencing technique was used from the
Ion Torrent Platform, the suspensions of tissues that composed pools of up to 25 samples
were removed, grouped considering the mammal species and their place of origin: Una ,
Ilhéus, Belmonte and Mascote, resulting in a total of 15 pools. The pools obtained were
sequenced on the Ion Torren Platform, with Plasmodium berghei and P. yeolli yeolli being
detected in rodents (Hylaeamys laticeps and Thaptomys nigrita) and marsupials (Marmosa
murina) and Besnoitia besnoiti in marsupials (Marmosa demerarae) and rodents (Akodon
cursor). In this study, there was no association between the detected protozoan species and
the municipality of origin of the sample, as well as the species. The present study allowed to
verify the presence of protozoa in wild mammals on the southern coast of the State of Bahia,
using molecular techniques. In addition, the systematic review and meta-analysis will serve as
a basis to inform the current context of T. cruzi infection in wild mammals in Brazil. | pt_BR |
dc.language | por | pt_BR |
dc.publisher | Universidade Federal da Bahia | pt_BR |
dc.rights | Acesso Aberto | pt_BR |
dc.subject | Mamíferos Silvestres | pt_BR |
dc.subject | Nested-PCR | pt_BR |
dc.subject | Protozoários | pt_BR |
dc.subject | Trypanosoma cruzi | pt_BR |
dc.subject | Sequenciamento de DNA de última geração (NGS); Revisão Sistemática. | pt_BR |
dc.subject.other | Wild Mammals; Protozoa; Trypanosoma cruzi; nested-PCR | pt_BR |
dc.subject.other | Next generation DNA sequencing (NGS); Systematic review and meta-analysis. | pt_BR |
dc.title | Detecção molecular de protozoários em mamíferos silvestres oriundos da Mata Atlântica - Bahia | pt_BR |
dc.type | Tese | pt_BR |
dc.publisher.program | Programa de Pós-Graduação em Ciência Animal nos Trópicos (PPGCAT) | pt_BR |
dc.publisher.initials | UFBA | pt_BR |
dc.publisher.country | Brasil | pt_BR |
dc.subject.cnpq | CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS | pt_BR |
dc.contributor.advisor1 | Silva, Aristeu Vieira da | - |
dc.contributor.referee1 | Silva, Aristeu Vieira da | - |
dc.contributor.referee2 | Lima, Artur Gomes Dias | - |
dc.contributor.referee3 | Oliveira, Eddy José Francisco de | - |
dc.contributor.referee4 | Gois, Marcelo Biondaro | - |
dc.contributor.referee5 | Santos, Silvane Maria Braga | - |
dc.creator.Lattes | http://lattes.cnpq.br/3490569565410575 | pt_BR |
dc.description.resumo | A Mata Atlântica é um bioma que apresenta uma grande diversidade de espécies endêmicas, como
também a que possui o maior índice de espécies com perigo de extinção, fato este que torna o bioma
como um hotspot para a preservação da biodiversidade. O desequilíbrio ambiental possui um forte
poder na difusão e no aparecimento de doenças parasitárias em mamíferos silvestres, e dentre as
parasitoses encontradas tem-se aquelas causadas por protozoários. Dessa forma, o objetivo deste
trabalho foi avaliar as taxas de infecção entre diferentes ordens de mamíferos no Brasil, através da
revisão sistemática e meta-análise e conhecer a diversidade de protozoários em pequenos mamíferos
oriundos do litoral Sul baiano no Estado da Bahia. Para a revisão foi realizada uma busca nas bases de
dados Pubmed, Medline, Lilacs, Science direct e Scielo, sem filtro de idioma e com filtro de tempo de
2000-2020. Para condução desse processo, adotou-se a ferramenta StArt. Com base nos critérios de
seleção todos os estudos que relatavam a infecção de T. cruzi em mamíferos silvestres no Brasil foram
escolhidos. Para análises estatísticas foi utilizada a estatística descritiva e a meta-análise do evento
dicotômico com a distribuição binominal, conduzida em Microsoft Excel. Para avaliar a
heterogeneidade entre os estudos foi utilizado o cálculo das estatísticas Q e I
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. Depois de ler todos os
resumos e com base nos critérios de seleção, 35 estudos continha informações importantes da infecção
em mamíferos silvestres. Entre as nove ordens de mamíferos silvestres identificadas como reservatório
para o T. cruzi, três dessas ordens apresentaram maior frequência combinada: Chiroptera (55,57%);
Carnívora (38,10%) e Primata (27,85%), pelo diagnóstico molecular. A detecção de protozoários foi
realizada a partir de amostras de tecidos de mamíferos silvestres das ordens Rodentia e
Didelphimorphia, em pool de órgãos (coração, encéfalo, pulmão, fígado e baço) de cada animal, que
foram macerados e armazenados a -20oC. Para a detecção de T. cruzi foi realizada extração de DNA
utilizando kit comercial e quantificação em NanoDrop®, seguida de nested-PCR para amplificação de
sequências de kDNA com uso dos iniciadores S17 e S18. Dos 153 mamíferos silvestres identificados
na ordem Didelphimorphia e Rodentia, foram examinados exemplares de seis e treze espécies de cada
ordem, respectivamente. Um Didelphis aurita apresentou amplificação de DNA compatível com
Trypanosoma ssp, correspondendo a 0,65% das amostras examinadas. Para a análise dos pools obtidos
foi utilizada a técnica de sequenciamento de nova geração a partir da Plataforma Ion Torrent, foram
retiradas as suspensões de tecidos que compuseram pools de até 25 amostras, agrupadas considerando
as espécies de mamíferos e o seu local de origem: Una, Ilhéus, Belmonte e Mascote, resultando num
total de 15 pools. Os pools obtidos foram sequenciados na Plataforma Ion Torren, sendo detectados
Plasmodium berghei e P. yeolli yeolli em roedores (Hylaeamys laticeps e Thaptomys nigrita) e
marsupiais (Marmosa murina) e Besnoitia besnoiti em marsupiais (Marmosa demerarae) e roedores
(Akodon cursor). Nesse estudo, não houve associação entre a espécie de protozoário detectado e o
município de origem da amostra, bem como a espécie. O presente estudo permitiu verificar a presença
de protozoários em mamíferos silvestres no litoral Sul do Estado da Bahia, utilizando técnicas
moleculares. Além disso, a revisão sistemática e meta-análise servirão como base para informar o
atual contexto da infecção de T. cruzi em mamíferos silvestres no Brasil. | pt_BR |
dc.publisher.department | Escola de Medicina Veterinária e Zootecnia | pt_BR |
dc.type.degree | Doutorado | pt_BR |
Aparece nas coleções: | Tese (PPGCAT)
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